Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms