Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SGIP1Q9BQI5 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGIP1Q9BQI5 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms