Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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