Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC7Q96M83 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms