Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF34Q969K3 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms