Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms