Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms