Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms