Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBLCP1Q8WVY7 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms