Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms