Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms