Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms