Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED27Q6P2C8 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms