Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms