Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms