Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms