Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms