Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms