Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FHOD3Q2V2M9 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FHOD3Q2V2M9 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms