Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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