Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms