Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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