Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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