Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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NCOA1Q15788 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
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NCOA1Q15788 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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NCOA1Q15788 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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NCOA1Q15788 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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NCOA1Q15788 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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NCOA1Q15788 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
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NCOA1Q15788 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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NCOA1Q15788 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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NCOA1Q15788 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
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NCOA1Q15788 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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