Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC1A5Q15758 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms