Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRADDQ15628 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms