Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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