Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB35Q15286 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms