Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA3AQ14563 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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