Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1A4Q13733 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms