Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTCH1Q13635 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTCH1Q13635 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTCH1Q13635 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTCH1Q13635 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTCH1Q13635 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTCH1Q13635 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTCH1Q13635 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTCH1Q13635 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTCH1Q13635 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTCH1Q13635 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTCH1Q13635 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTCH1Q13635 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTCH1Q13635 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTCH1Q13635 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PTCH1Q13635 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTCH1Q13635 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTCH1Q13635 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTCH1Q13635 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTCH1Q13635 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTCH1Q13635 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms