Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 DRC7-203ENST00000394337 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 IYD-208ENST00000500320 2158 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
UBE2V1Q13404 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms