Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR5A1Q13285 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 768.6 ms