Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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IFT88Q13099 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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IFT88Q13099 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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IFT88Q13099 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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IFT88Q13099 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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IFT88Q13099 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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IFT88Q13099 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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IFT88Q13099 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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IFT88Q13099 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFT88Q13099 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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