Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP3Q12983 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms