Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SSRP1Q08945 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms