Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms