Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
LRP1Q07954 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms