Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms