Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALD1Q05682 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms