Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAV1Q03135 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms