Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms