Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSG1Q02413 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms