Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR1P84550 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms