Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms