Protein–RNA interactions for Protein: P61026

RAB10, Ras-related protein Rab-10, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB10P61026 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB10P61026 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB10P61026 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB10P61026 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB10P61026 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms