Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms