Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01547P58512 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms