Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BACE1P56817 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BACE1P56817 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BACE1P56817 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BACE1P56817 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BACE1P56817 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BACE1P56817 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BACE1P56817 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BACE1P56817 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BACE1P56817 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BACE1P56817 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BACE1P56817 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BACE1P56817 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BACE1P56817 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BACE1P56817 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BACE1P56817 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BACE1P56817 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BACE1P56817 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BACE1P56817 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BACE1P56817 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BACE1P56817 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BACE1P56817 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BACE1P56817 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BACE1P56817 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BACE1P56817 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BACE1P56817 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BACE1P56817 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms