Protein–RNA interactions for Protein: P55290

CDH13, Cadherin-13, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH13P55290 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH13P55290 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH13P55290 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH13P55290 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH13P55290 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH13P55290 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH13P55290 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH13P55290 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH13P55290 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH13P55290 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH13P55290 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH13P55290 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH13P55290 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH13P55290 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH13P55290 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH13P55290 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms